技術文章您的位置:網站首頁 >技術文章 >BBRC:DAP-seq解析擬南芥ABA-PIFs信號通路

BBRC:DAP-seq解析擬南芥ABA-PIFs信號通路

更新時間:2021-06-25   點擊次數:3615次

       敏色素互作因子(PIFs)廣泛存在于苔蘚到被子植物中,并在植物從暗形態建成到光形態建成的轉化過程中發揮關鍵調控作用。PIFs直接與靶基因啟動子區域的順式作用元件結合,調控基因表達,或者與其它調控因子形成復合物,共同調控靶基因表達,PIFs是基因轉錄調控網絡中的核心,通過整合內部和外部的信號以實現對植物體生長發育的調控。植物激素脫落酸(Abscisic Acid,ABA)調控植物的生長發育和對逆境脅迫的響應。ABA信號通路的很多組分已經被鑒定出來。

       越來越多的證據證明,ABA與PIFs轉錄因子家族在光信號通路、植物生長發育和環境適應性方面具有協同作用。但是PIFs轉錄因子調控ABA信號轉導的具體機制并不清楚。

       2020年4月,Biochemical and Biophysical Research Communications發表了題為“ Phytochrome-interacting factors regulate seedling growth through ABA signaling”的文章,為揭示PIFs轉錄因子調控ABA信號轉導機制提供了重要線索。

 

研究結果

1. PIFs轉錄因子在擬南芥各器官中廣泛表達并且受到ABA調控

       通過RT-qPCR發現PIF1, PIF3, PIF4和PIF5在多種組織器官和發育階段均有表達。ABA處理后,PIF1, PIF3和PIF4的表達水平升高,但是PIF5的表達受到抑制。

2. pif突變體在幼苗生長期對脫落酸不敏感

       首先構建了pif1, pif3, pif4, pif5, pif3/4/5, pif1/3/4/5和pif1/3/4突變體并對突變效果進行了驗證。將突變體和野生型種子在含有ABA的培養基中培養,與野生型相比,pif突變體在幼苗生長階段,呈現出對ABA脫敏的表型。

3. 過表達PIF3和PIF5增強了幼苗對脫落酸的敏感性

       為進一步驗證PIFs轉錄因子在ABA信號通路中的作用,將PIF3和PIF5的過表達株系在ABA的培養基中培養,與野生型相比,過表達植株的生長受到明顯抑制,呈現出對ABA超敏感的表型。

 

4. 通過DAP-seq分析在基因組水平上鑒定PIF3和PIF5轉錄因子在DNA上的結合位點

        已經有多項研究使用ChIP-seq對PIFs轉錄因子在基因組水平的結合位點進行了鑒定,但是ChIP-seq方法受限于特異性抗體的質量,并且操作復雜,實驗難度大。本研究使用了一種新的方法:DAP-seq(DNA親和純化測序)對PIF3和PIF5在基因組上結合位點進行了鑒定。最終鑒定出PIF的保守motif為G-box,與已有的研究結果一致,并且鑒定出一批ABA響應的基因是PIFs的下游靶基因,比如PYL3,PYL6, PYL12, SnRK2.2, CPK4, CPK6, ABI5, ABF3和KIN1。2020年2月,在Molecular Plant期刊上使用酵母單雜交、EMSA等技術證明PIF1、PIP4和PIF5能夠結合到ABI5啟動子區的G-box上(Qi et al., 2020)。DAP-Seq的結果與此結果相互印證。本研究證明了DAP-seq的可行性和有效性。

討論

      該研究通過DAP-seq鑒定出很多與ABA相關的PIFs靶基因、參與ABA合成的基因通路以及ABA信號轉導通路中的組分。揭示了PIFs參與ABA信號轉導的機制并非簡單的單向調節,還存在反饋調控閉環。

參考文獻:

Liang S, Gao X, Wang Y, Zhang H, Yin K, Chen S, Zhang M, Zhao R. Phytochrome-interacting factors regulate seedling growth through ABA signaling. Biochem Biophys Res Commun. 2020. 526(4):1100-1105. doi: 10.1016/j.bbrc.2020.04.011.

Qi L, Liu S, Li C, Fu J, Jing Y, Cheng J, Li H, Zhang D, Wang X, Dong X, Han R, Li B, Zhang Y, Li Z, Terzaghi W, Song CP, Lin R, Gong Z, Li J. PHYTOCHROME-INTERACTING FACTORS interact with the ABA receptors PYL8 and PYL9 to orchestrate ABA signaling in darkness. Mol Plant. 2020. 13(3):414-430. doi: 10.1016/j.molp.2020.02.001.

 

藍景科信是國內shou家商業化DAP-seq服務的機構,具有豐富的項目經驗,專業高效服務50多家院校機構。

藍景科信提供DAP-seq全流程技術服務和個性化數據分析,具有50多個物種,300多個轉錄因子的實戰經驗。

藍景科信DAP-seq已做物種:

擬南芥,煙草,水稻,小麥,藜麥,玉米,大豆,棉花,苜蓿,高粱,大麥草,百脈根,油菜,白菜,黃瓜,菜心,番茄,荔枝,香蕉,葡萄,蘋果,柑橘,甜橙,桃,甜瓜,甘蔗,櫻桃,草莓,杜梨,芍藥,棗,核桃,毛果楊,胡楊,油松,毛白楊,山新楊,歐美楊,大青楊,84K楊,白樺,光皮樺,歐洲云杉,剛毛怪柳,麻瘋樹,金銀花,丹參,木薯,地錢,腐霉,苔蘚,糙皮側耳,豬苓真菌,飛蝗,肺炎克雷伯菌,布魯氏菌。




主站蜘蛛池模板: 日本dhxxxxxdh14日本| 再深点灬舒服灬快h视频| 免费A级毛片在线播放不收费 | 女偶像私下的y荡生活| 国产精品亚洲欧美大片在线观看 | 公和我做好爽添厨房| 中文字幕无码乱人伦| 2019天天干| 老司机久久精品| 欧美黑人性暴力猛交喷水| 欧美疯狂做受xxxxx高潮| 无遮挡韩国成人羞羞漫画网站 | 国产男女猛烈无遮挡免费视频| 古代级a毛片在线| 亚洲中文久久精品无码1| 一级做a爰片毛片| 美女扒开屁股让男人桶| 我和小雪在ktv被一群男生小说| 国产中文字幕在线| 久久777国产线看观看精品| 日本高清xxxxx| 欧美va天堂在线影院| 国产福利一区视频| 亚洲精品国产av成拍色拍| 中国老师69xxxx高清hd| 黑人与中国女一级毛片不卡| 欧美综合自拍亚洲综合图| 国产精品蜜臂在线观看| 免费黄色在线网站| 两个人在线观看的高清| 韩国一区二区视频| 日韩一区二区在线免费观看| 国产精品永久在线观看| 伊人久久大香线蕉精品| 中国体育生gary飞机| 精品久久久久久久久中文字幕| 日本免费一区二区三区最新 | 91麻豆国产在线观看| 精品国产乱码久久久久软件| 日韩欧美亚洲综合久久| 国产国语一级毛片全部|